Храм построили в 1835 году по типовому проекту в духе классицизма. Помещение трапезной завершалось четырехъярусной колокольней со шпилем. После утверждения советской власти, в 1922 году в Чистополье появилась первая в Котельническом уезде крестьянская коммуна. Храм закрыли тогда же. До войны он простоял без крестов, а на фото 1942 года видно, что его уже начинали разрушать. Снесли церковь в послевоенные годы. Уцелевшая колокольня доныне ветшает.
Старинная и высокая колокольня храма Иоанна Предтечи видна на десятки километров. Ныне не действует, но собой являет символ села Чистополье. При должной сноровке можно и забраться на неё и осмотреть окрестности с высоты.