Саппоро расположен в зоне влажного континентального климата (классификация климатов Кёппена — Dfa/Dfb). Лето довольно жаркое, но не влажное, зимы достаточно холодные и снежные. Суммарная годовая высота снежного покрова — 597 см. Годовая норма осадков — примерно 1100 мм.