Закари Джон Куинто родился 2 июня 1977 года в Питтсбурге (штат Пенсильвания, США) в ирландско-итальянской семье. Его мать Маргарет Дж. «Марго» Макардл работала в инвестиционной компании, а отец, Джозеф Джон «Джо» Куинто, был парикмахером. Он скоропостижно скончался от рака, когда Закари исполнилось семь лет. После мама в одиночку воспитывала Закари и его брата Джо.