Марио Манджукич — хорват по национальности. Его родина — Югославия, крупный промышленный центр Славонски-Брод. В 1992 году семья перебралась в Германию. Там отец мальчика, Мичу, играл в футбол профессионально, чтобы зарабатывать на жизнь. Сын сопровождал отца на тренировки и постепенно приобщился к немецкой школе футбола. После того как Манджукичам отказали в виде на жительство, они вернулись в Хорватию. Марио стал играть за местный клуб «Марсония», за который выступил в 23 матчах и забил 14 голов.