Монастырь Киккос был основан примерно в конце XI века византийским императором Алексеем I Комнином. После пожара, случившегося в 1365 году, монастырь был выстроен заново, на этот раз из дерева и камня. В 1541 году монастырь вновь сгорел и был отстроен полностью из камня. В 1926 году в Киккском монастыре начал своё церковное восхождение Макарий (Мускос), ставший впоследствии представителем Кипрской Церкви и первым президентом Кипра. В 1986 году был учреждён Исследовательский центр Киккского монастыря, где находится архив и богатейшая библиотека. По решению игумена Никифора (Киккотиса) в 1995 году был открыт музей Свято-Киккского монастыря. 10 июня 2012 года монастырь посетил Патриарх Московский и всея Руси Кирилл, совершавший визит в Кипрскую Церковь.