Бластоцисты (Blastocystis spp.). — простейшие одноклеточные микроорганизмы, которые колонизируют желудочно-кишечный тракт и могут нарушать его функции. Во многих случаях они выявляются в сочетании с другими патогенами желудочно-кишечного тракта: лямблиями, сальмонеллами, стафилококками и иными возбудителями острых кишечных инфекций.
Бластоцисты впервые были обнаружены ещё в 1849 году.