Южный Памир охватывает долину Аличура, Северо-Аличурский, именуемый также Базардара (длина ок. 130 км. высота до 5929 м.) и Южно-Аличурский (длина ок. 150 км. высота 5706 м. г. Кызылданги) хребты; верховья Оксу и район Зоркуля. Он отличается тем, что получает больше осадков, и более резким рельефом. По долине Аличура и вдоль озера Зоркуль широкими полосами идут зеленые луга. Хребты достигают 5000—5700 м высоты.