Рифовый скат манта широко распространен в тропических и субтропических частях Индо-Тихоокеанского региона, с небольшим количеством записей в теплой Восточной Атлантике и ни одной в Западной Атлантике или восточной части Тихого океана. Его можно наблюдать в нескольких часто посещаемых регионах, таких как Гавайи, Фиджи, Французская Полинезия, Микронезия, Бали, Комодо, Мальдивы, Мозамбик, Австралия и Филиппины. В основном он встречается в прибрежных районах.