Целенаправленный процесс добавления, удаления или модификации генетических последовательностей в живых клетках для достижения целей биологической инженерии, таких как изменение клеточного производства, изменение требований к росту и пролиферации клеток, добавление или удаление клеточных функций и многое другое. Клеточная инженерия часто использует ДНК-технологию для достижения этих модификаций, а также тесно связанные с ней методы тканевой инженерии. Клеточную инженерию можно охарактеризовать как промежуточный уровень во все более специфических дисциплинах биологической инженерии, которая включает в себя органолептическую инженерию, тканевую инженерию, белковую инженерию и генную инженерию.